Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms