Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Apobec3Q99J72 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Apobec3Q99J72 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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