Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctu1Q99J10 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms