Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms