Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col26a1Q91VF6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms