Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms