Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Abcf3Q8K268 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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