Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Habp2Q8K0D2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Habp2Q8K0D2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Habp2Q8K0D2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms