Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rbm17Q8JZX4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rbm17Q8JZX4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm17Q8JZX4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms