Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms