Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Brf1Q8CFK2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Brf1Q8CFK2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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