Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ercc8Q8CFD5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ercc8Q8CFD5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ercc8Q8CFD5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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