Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc178Q8CDV0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc178Q8CDV0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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