Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nsun3Q8CCT7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms