Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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