Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc113Q8C5T8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ccdc113Q8C5T8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc113Q8C5T8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc113Q8C5T8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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