Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcaphQ8C156 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NcaphQ8C156 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcaphQ8C156 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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