Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rbbp5Q8BX09 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms