Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms