Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssc5dQ8BV57 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssc5dQ8BV57 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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