Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms