Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htatsf1Q8BGC0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms