Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pcsk9Q80W65 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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