Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NischQ80TM9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NischQ80TM9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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