Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms