Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms