Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms