Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sys1Q78S06 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sys1Q78S06 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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