Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms