Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms