Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt40Q6IFX3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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