Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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