Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms