Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ctr9Q62018 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctr9Q62018 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ctr9Q62018 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctr9Q62018 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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