Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Mre11Q61216 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mre11Q61216 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mre11Q61216 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mre11Q61216 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mre11Q61216 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms