Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms