Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurod1Q60867 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms