Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf3Q60765 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms