Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samhd1Q60710 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samhd1Q60710 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms