Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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CttnQ60598 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CttnQ60598 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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