Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Phf12Q5SPL2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms