Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bhlha9Q5RJB0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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