Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
E2f8Q58FA4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2f8Q58FA4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms