Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn34b4Q3V0X2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34b4Q3V0X2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cldn34b4Q3V0X2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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