Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbm44Q3V089 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbm44Q3V089 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms