Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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