Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Capn13Q3UW68 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Capn13Q3UW68 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Capn13Q3UW68 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Capn13Q3UW68 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Capn13Q3UW68 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms