Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6899Q3USS0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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