Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Shisa3Q3UPR0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa3Q3UPR0 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms