Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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